Bimbingan Konseling dalam sistem pendidikan di Indonesia beberapa kali mengalami perubahan nama. Pada kurikulum 1984 semula disebut Bimbingan dan Penyuluhan (BP), kemudian pada Kurikulum 1994 berganti nama menjadi Bimbingan dan Konseling (BK) sampai dengan sekarang. Layanan BK sudah mulai dibicarakan di Indonesia sejak tahun 1962. Namun BK baru diresmikan di sekolah di Indonesia sejak diberlakukan kurikulum 1975. Kemudian disempurnakan ke dalam kurikulum 1984 dengan memasukkan bimbingan karir didalamnya. Beberapa kecenderungan yang dirasakan pada masa itu adalah kebutuhan akan profesionalisasi layanan, keterpaduan pengelolaan, sistem pendidikan konselor, legalitas formal, pemantapan organisasi, pengmbangan konsep – konsep bimbingan yang berorientasi Indonesia, dsb.
Program Studi Bimbingan dan Konseling Islam (BKI) merupakan salah satu program studi di Fakultas Ushuluddi Adab dan Dakwah (FUAD) Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Samarinda. Prodi BKI adalah salah satu program studi baru yang berdiri pada tahun 2013 berdasarkan Surat Keputusan Ketua STAIN No. 020 Tahun 2013. Pada tahun 2014, BKI mendapat persetujuan dari Direktur Jenderal Pendidikan Islam untuk menyelenggarakan program studi berdasarkan Surat Keputusan No. 4948 Tahun 2014. Izin tersebut kemudian diperpanjang pada tahun 2016 berdasarkan SK no. 1653 Tahun 2016.